Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm527Q4KL13 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm527Q4KL13 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms