Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al1nQ497L1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms