Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr1d1Q3UV55 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr1d1Q3UV55 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms