Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms