Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip13Q3UA06 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms