Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms