Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPNMBQ14956 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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