Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samd12Q0VE29 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms