Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox9Q04887 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox9Q04887 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms