Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GscQ02591 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GscQ02591 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GscQ02591 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GscQ02591 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GscQ02591 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GscQ02591 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GscQ02591 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GscQ02591 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms