Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1cQ01815 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms