Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp1Q01514 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms