Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VegfaQ00731 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms