Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms