Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig3P97386 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms