Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms