Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext2P70428 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ext2P70428 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms