Protein–RNA interactions for Protein: P63280

Ube2i, SUMO-conjugating enzyme UBC9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2iP63280 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2iP63280 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2iP63280 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2iP63280 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2iP63280 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2iP63280 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2iP63280 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2iP63280 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2iP63280 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms