Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg6P61406 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg6P61406 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg6P61406 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg6P61406 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg6P61406 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg6P61406 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smg6P61406 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smg6P61406 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg6P61406 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms