Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gsc2P56916 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms