Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RabggtbP53612 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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