Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn1P51942 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms