Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gbx2P48031 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx2P48031 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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