Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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