Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elk4P41158 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk4P41158 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Elk4P41158 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk4P41158 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Elk4P41158 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elk4P41158 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Elk4P41158 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elk4P41158 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elk4P41158 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms