Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VhlP40338 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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VhlP40338 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VhlP40338 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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