Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp4P35123 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms