Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrbP28704 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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