Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxraP28700 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxraP28700 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxraP28700 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxraP28700 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxraP28700 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxraP28700 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxraP28700 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxraP28700 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxraP28700 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxraP28700 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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