Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb3P28231 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms