Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CftrP26361 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CftrP26361 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CftrP26361 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CftrP26361 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CftrP26361 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CftrP26361 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CftrP26361 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CftrP26361 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CftrP26361 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CftrP26361 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CftrP26361 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms