Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd8P23463 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms