Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VimP20152 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VimP20152 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VimP20152 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms