Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrphP15331 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrphP15331 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PrphP15331 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrphP15331 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrphP15331 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrphP15331 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrphP15331 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrphP15331 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrphP15331 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrphP15331 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrphP15331 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms