Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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