Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem254bP0DN90 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms