Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms