Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoa4P06728 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa4P06728 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms