Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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