Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01679 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01679 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01679 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms