Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan6O70401 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 493.7 ms