Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms