Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms