Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CrxO54751 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CrxO54751 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CrxO54751 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms