Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sp100O35892 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms