Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm17078M0QW51 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm17078M0QW51 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm17078M0QW51 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm17078M0QW51 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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