Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm20395-201ENSMUST00000173799 690 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm5893-201ENSMUST00000135286 1880 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms