Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms