Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd5G3UW60 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms