Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r85G3UW56 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms